La nación comprendió la necesidad de eliminar sin demora la peligrosa amenaza en el extremo norte de su territorio, y es así como, sin pretensiones de expansión territorial, Chile debió recurrir a las armas como medida precautoria para asegurar su subsistencia como nación libre y soberana.
Dada la inferioridad potencial de la Escuadra peruana, no podía arriesgarse a dar una batalla naval decisiva, pero sí podía accionar ofensivamente sobre objetivos aislados y hacer guerra de corso.
La ubicación del teatro de operaciones marítimo estaba enorme distancia de la base de la Escuadra chilena en Valparaíso, lo que significó una considerable limitación logística.
Al regreso de la Escuadra a Iquique, el Almirante Juan Williams Rebolledo ordenó a las autoridades del puerto detener las plantas destiladoras de agua y el ferrocarril. Pero la escuadra enemiga no se presentó a dar batalla, entonces el Jefe Naval decidió cambiar el plan.
El Capitán de Fragata Juan José Latorre aplicó correctamente el principio de mantenimiento del objetivo. Dos naves enfrentaron a una más débil y resultaron rechazadas con averías.
El 20 de mayo zarpaban desde Arica el monitor "Huáscar" y la fragata blindada "Independencia" y al día siguiente a las 08:00 horas entraban a la rada de Iquique. El mismo día entraba la Escuadra nacional en El Callao, encontrando una base naval ausente de objetivos.
Los héroes de Iquique dejaron señalado el camino de la victoria: cada chileno se sintió comprometido con el ejemplo y comprendieron que había que seguir la ruta de la entrega total al servicio de la nación en guerra.
La “Independencia” acertó sobre la “Covadonga” una serie de tiros que dañaron los palos, jarcias, botes y carboneras. Habiendo tomado la nave peruana la estela de la goleta, las únicas piezas de artillería realmente peligrosas de los peruanos eran el cañón de proa y las ametralladoras instaladas en la cofa del palo trinquete.
El Monitor "Huáscar" y su brillante Comandante continuaban atacando nuestros puertos, destruyendo instalaciones portuarias y embarcaciones para afectar el esfuerzo económico necesario para sostener la guerra.
Con el dominio del mar asegurado, el Ejército obtuvo la libertad de acción estratégica que le permitiera atacar al enemigo dónde, cuándo y cómo lo estimara más conveniente.
Se decidió tenderle una celada a los buques peruanos. La División al mando del Comandante Galvarino Riveros Cárdenas lo esperaría a la entrada de Antofagasta, mientras que los buques de la División del Comandante Juan José Latorre Benavente, establecerían una barrera perpendicular a la costa, más al norte y hasta 20 millas de tierra.
Mediante el desembarco de las sucesivas oleadas, el combate cobró mayor vigor, y tras bravo esfuerzo, las tropas chilenas llegaron hasta la pampa del Hospicio en la cumbre de la meseta.
El Almirante Galvarino Riveros Cárdenas, al mando de la Escuadra chilena, decidió dar caza a la cañonera "Pilcomayo" y ordenó al Comandante del "Blanco", Capitán de Corbeta Luis Anacleto Castillo Goñi, perseguir a máximo andar a la cañonera peruana.
El objetivo político de guerra chileno fue más ambicioso, y ya no sólo se buscó asegurar la soberanía chilena entre los paralelos 23 y 25 Sur.
Entre el 18 y 25 de febrero de 1880 se embarcaron en Pisagua los 9.500 soldados que componían tres divisiones, quedando una en tierra en espera del regreso de los transportes.
Sabedor Carlos Condell de la Haza de la muerte del bravo Thomson, se transbordó el monitor "Huáscar" y envió a la cañonera "Magallanes" a dar cuenta de lo sucedido al Almirante Galvarino Riveros Cárdenas.
El Almirante Galvarino Riveros Cárdenas haciendo honor al valor demostrado por el Teniente Gálvez, en vez de mantenerlo prisionero, lo puso a disposición de las autoridades de El Callao.
La "Fresia" rompió el fuego contra la flotilla enemiga, mientras acudían en su ayuda las lanchas "Guacolda" y "Colo Colo" y posteriormente la "Tucapel" y el escampavías "Toro" armado con 1 cañón de 40 lbs y el "Lautaro", con un cañón de 40 lbs y dos cañones de 6 lbs.